أعلنت قوات الاحتلال انتهاء العملية العسكرية في مجمع ناصر. ووردت تقارير عن انتشال جثامين نحو 5 شهداء بالقرب من مجمع ناصر الطبي.

انسحبت قوات الاحتلال من داخل مجمع ناصر الطبي، مع تمركزها في المناطق المحيطة بالمجمع، ثم عاودت اقتحام المجمع بأربع ناقلات جند في اليوم نفسه.

اعتقلت قوات الاحتلال عدد من الكوادر الطبية أثناء سيرها في "الممر الآمن" منهم الطبيب ناهض أبو طعيمة مدير مجمع ناصر الطبي، إضافة إلى إعتقال عدد من النازحين والمرضى.

 اقتحمت قوات الاحتلال ساحة مجمع ناصر الطبي بعد هدم السور الجنوبي، وحولته إلى ثكنة عسكرية، وجرفت ساحاته، وأطلقت النار نحو أقسامه الطبية، واستخدمت الكلاب لإرهاب النازحين والمرضى، واعتقلت عدداً من الكوادر الطبية والنازحين ممن خرجوا من المجمع .  

أجبرت قوات الاحتلال آلاف النازحين والمرضى على الخروج من مجمع ناصر الطبي تحت تهديد السلاح وكثافة النيران. فقد بقي نحو 190 من كوادر المجمع و299 من أفراد عائلاتهم في داخله، بالإضافة إلى 273 مريضاً لا يستطيعون الحركة و327 مرافقاً لهم. كما قامت قوات الاحتلال بقصف الطابق الثالث من المستشفى، ما أسفر عن إصابة طبيب. وقصفت قوات الاحتلال قسم العظام، ما أسفر عن استشهاد مريض وسقوط عدة إصابات. ومنعت قوات الاحتلال بعثتين من الوصول، وفقد طاقم منظمة الصحة العالمية تواصله بموظفي مجمع ناصر الطبي.

هدمت قوات الاحتلال السور الشمالي للمجمع، وأبلغت إدارة المجمع بإخلائه من النازحين والمرضى والطواقم الطبية كما جرى إطلاق النار على كل من كان يحاول الخروج والإخلاء عند بوابة المستشفى، وجرى استهداف مدارس محيطة بالمجمع، ما أدى إلى اشتعال النار فيها وانتقالها إلى مخزن الأجهزة الطبية واحتراقه بالكامل، وأيضاً إلى مخزن المهمات الطبية واحتراقه بنسبة 80%. ولم تستطع إدارة المجمع نقل الشهداء والموتى من المرضى إلى ثلاجة الموتى بسبب الخطر الشديد في ظل استمرار الحصار الإسرائيلي بشكل مطبق على المجمع حتى هذه اللحظة.

أعلنت وزارة الصحة أنه تم دفن نحو 40 شهيداً في ساحة المجمع، وأشارت إلى صعوبة وتأخر وصول المصابين إلى المجمع، بالإضافة إلى وجود صعوبة بالغة في علاج عشرات الحالات الخطرة التي فاقت القدرة الاستيعابية لغرف العمليات والعناية المركزة.

كثفت قوات الاحتلال قصف محيط مجمع ناصر الطبي وازدادت وتيرة إطلاق النار، وقطعت آليات الاحتلال الطريق المؤدي إلى مستشفى ناصر.

في 7 تشرين الأول/ أكتوبر 2023، استهدفت طائرات الاحتلال مجمع ناصر الطبي بعد استهداف سيارة إسعاف كانت بالقرب منه، ما أدى إلى حدوث أضرار بالغة وتحطم كل زجاج شبابيك مبنى إدارة المجمع. 

أعلن المكتب الإعلامي الحكومي في غزة اكتشاف مقبرة جماعية ثالثة في مجمع الشفاء الطبي و انتشال 49 جثة.